| 明治2年 | 4月 | 神戸病院が創立、同院内に医師養成場（医学伝習所）が設置された。 |
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| 明治9年 | | 医学伝習所が神戸病院附属医学所と改称された。 |
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| 明治10年 | 2月 | 神戸病院が公立神戸病院と改称された。 |
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| 明治15年 | 4月 | 県立神戸医学校が設置された。 |
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| 明治15年 | 12月 | 公立神戸病院が県立神戸病院と改称された。 |
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| 明治16年 | 4月 | 県立神戸医学校附属薬学校が設置された。 |
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| 明治17年 | 2月 | 同附属薬学校が県立薬学校と改称された。 |
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| 明治21年 | 3月 | 県立神戸医学校、同薬学校が廃校となる。 |
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| 昭和19年 | 4月 | 県立医学専門学校が設置された 県立神戸病院が県立医学専門学校附属医院と改称された。 |
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| 昭和21年 | 4月 | 県立医科大学が設置された（19講座、入学定員80人）。 |
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| 昭和24年 | 4月 | 県立医科大学附属高等看護学院The Nursing School attached to the Hyogo Prefectural College of Medicineが設置された。 |
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| 昭和26年 | 3月 | 県立医学専門学校が廃止された。
県立医科大学予科が閉科された（学制改革）。 |
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| 昭和27年 | 2月 | 県立神戸医科大学が設置された。
県立医科大学附属医院が県立神戸医科大学附属病院と改称された。 |
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| 昭和27年 | 4月 | 神戸医科大学の開校式が挙行された |
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| 昭和28年 | 4月 | 附属科学捜査研究所を附属法医学研究所と改称された。
生理学第二講座及び精神神経科学講座が設置された。
旧制研究科が設置された。 |
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| 昭和29年 | 4月 | 病理学第二講座及び整形外科学講座が設置された |
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| 昭和30年 | 1月 | 医学進学課程が兵庫農科大学及び姫路工業大学に設置された。旧制学位審査権が附与される。 |
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| 昭和30年 | 4月 | 解剖学第二講座が設置された。 |
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| 昭和32年 | 4月 | 衛生学公衆衛生学講座が廃止、衛生学講座及び公衆衛生学講座が設置された。 |
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| 昭和32年 | 9月 | 附属法医学研究所その他を統合し、附属研究所に改変された。 |
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| 昭和33年 | 3月 | 県立神戸医科大学大学院医学研究科（博士課程）が設置された。 |
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| 昭和33年 | 12月 | 大学本館等竣工 |
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| 昭和34年 | 4月 | 附属高等看護学院に保健学科を増設し、県立厚生女子専門学院に改称された。 |
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| 昭和35年 | 5月 | 附属研究所を附属成長機構研究所と改称 |
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| 昭和36年 | 3月 | 旧制県立医科大学、旧制研究科が廃止された。 |
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| 昭和37年 | 4月 | 皮膚泌尿器科学講座が廃止、皮膚科学講座及び泌尿器科学講座が設置された。 |
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| 昭和37年 | 7月 | 附属図書館竣工（443坪） |
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| 昭和38年 | 3月 | 実験動物舎竣工（211坪） |
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| 昭和38年 | 12月 | 閣議において県立神戸医科大学の昭和39年度国立移管が決定した。 |
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| 昭和39年 | 4月 | 神戸大学に医学部が設置され、県立神戸医科大学の国立移管が開始された。
医学進学課程全部、専門課程1年次、基礎医学10講座が移管された。 |
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| 昭和40年 | 1月 | 産業医学講座が廃止、医動物学講座が設置された。 |
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| 昭和40年 | 4月 | 国立移管第2年度として、基礎講座3講座、臨床講座5講座が移管された。 |
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| 昭和41年 | 4月 | 国立移管第3年度として、臨床講座5講座が移管された。 |
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| 昭和42年 | 4月 | 国立移管第4年度として、大学院医学研究科（博士課程）、臨床講座3講座及び附属図書館が移管された。 |
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| 昭和42年 | 6月 | 県立神戸医科大学附属病院及び県立厚生女子専門学院は、国立移管に伴い、神戸大学医学部附属病院及び同附属看護学校と改称された。
麻酔学講座が設置された。 |
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| 昭和43年 | 3月 | 国立移管完了により神戸医科大学及び神戸医科大学大学院が廃止された。 |
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| 昭和43年 | 4月 | 学部学生入学定員が100人となる |
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| 昭和44年 | 3月 | 医学部共同研究館竣工 |
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| 昭和44年 | 4月 | 内科学第三講座及び脳神経外科学講座が設置された。附属衛生検査技師学校が設置された（入学定員20人）。 |
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| 昭和47年 | 4月 | 附属衛生検査技師学校が附属臨床検査技師学校に改組された。 |
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| 昭和48年 | 3月 | 附属衛生検査技師学校が廃止された。 |
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| 昭和48年 | 4月 | 生化学講座が生化学第一講座に改称された。生化学第二講座及び放射線基礎医学講座が設置された。学部学生入学定員が120人、大学院学生入学定員が54人となる。附属動物実験施設が設置された |
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| 昭和51年 | 2月 | 基礎学舎（新営第1期工事）竣工 |
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| 昭和52年 | 3月 | 基礎学舎（新営第2期工事）竣工 |
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| 昭和53年 | 8月 | 附属看護学校及び同臨床検査技師学校の名谷地区への移転が完了した。 |
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| 昭和54年 | 3月 | 基礎学舎（新営第3期工事）竣工 |
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| 昭和54年 | 4月 | 附属医学研究国際交流センターInternational Center for Medical Research (ICMR), affiliated with Kobe University School of Medicineが設置された。口腔外科学講座が設置された。 |
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| 昭和56年 | 10月 | 神戸大学に神戸大学医療技術短期大学部School of Allied Medical Sciencesが併設された |
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| 昭和59年 | 4月 | 附属看護学校が廃止された。 |
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| 昭和60年 | 4月 | 附属臨床検査技師学校が廃止された。臨床検査医学講座が設置された。 |
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| 昭和63年 | 4月 | 老年医学講座が設置された。 |
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| 平成元年 | 4月 | 学部学生入学定員が100人となる。 |
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| 平成3年 | 4月 | 医学部及び附属病院の事務部を統合し、医学部事務部（総務課、管理課、学務課、医事課）に改組された。 |
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| 平成6年 | 10月 | 医学部保健学科が設置された（入学定員160人）。 |
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| 平成8年 | 4月 | 災害・救急医学講座が設置された。 |
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| 7月 | 管理棟竣工 |
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| 平成10年 | 3月 | 神戸大学医療技術短期大学部が閉学された。 |
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| 平成10年 | 4月 | 学部学生入学定員が95人となる（平成12年度より学士入学制度が導入された）（3年次編入；入学定員5人）。 |
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| 6月 | 臨床研究棟竣工。保健学科校舎竣工。 |
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| 平成11年 | 4月 | 大学院医学研究科が大学院医学系研究科に改称された。大学院医学系研究科保健学専攻（修士課程）が設置された。 |
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| 平成12年 | 4月 | 大学院医学系研究科内科学専攻に連携講座放射光医学が設置された（学内措置）。 |
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| 平成13年 | 2月 | 神緑会館The Shinryoku Hall竣工 |
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| 4月 | 大学院医学系研究科保健学専攻（博士後期課程）が設置された。
大学院医学系研究科生理学専攻等5専攻が医科学専攻に改組された。
大学院医学系研究科医科学専攻に基幹講座として9大講座、35教育研究分野、4協力講座（12教育研究分野）及び3連携講座（3教育研究分野）が設置された。
医学部医学科35講座を廃止し4大学科目となる。
大学院医学系研究科医科学専攻に連携講座映像粒子線医学を設置（学内措置）。 |
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| 平成14年 | 4月 | 大学院医学系研究科バイオメディカルサイエンス専攻（修士課程）が設置された（入学定員20人）。 |
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| 平成16年 | 4月 | 国立大学法人へ移行。
附属医学研究国際交流センターが附属医学医療国際交流センターに改組された。
医学部事務部（管理課）は（経営管理課）に改組された。
大学院医学系研究科医科学専攻に臨床薬効評価学講座が設置された（学内措置）。
大学院医学系研究科医科学専攻に立証検査医学講座が設置された（学内措置）。 |
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| 平成18年 | 1月 | 大学院医学系研究科医科学専攻にへき地医療学が設置された（学内措置）。 |
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| 平成19年 | 4月 | 大学院医学系研究科医科学専攻が次のように改められた。
■基礎医学領域：生理学・細胞生物学講座，生化学・分子生物学講座，病理学・微生物学講座，社会医学講座
■臨床医学領域：内科学講座，内科系講座，外科講座，外科系講座 |
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| 平成20年 | 4月 | 大学院医学系研究科を大学院医学研究科に改称。医学研究科医科学専攻を次のように改めた。
生理学・細胞生物学講座、生化学・分子生物学講座、病理学講座，微生物感染症学講座、社会医学講座、内科学講座、内科系講座、外科学講座、外科系講座。
また、連携講座感染症フィールド学、システム病態生物学、こども発育学及び乳腺内分泌外科を設置した。
大学院保健学研究科保健学専攻を設置した。 |
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| 平成20年 | 6月 | 大学院医学研究科医科学専攻にリウマチ学、リウマチ科を設置した。 |
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